Ηχηρή παρέμβαση για το σχέδιο μετατροπής της Αγίας Σοφίας σε τζαμί, έκανε ο Οικουμενικός Πατριάρχης Βαρθολομαίος. Έστειλε αυστηρό μήνυμα στην Άγκυρα πως αν πραγματοποιηθούν αυτά τα σχέδια, θα είχε ως αποτέλεσμα «να στραφούν εκατομμύρια χριστιανοί διεθνώς ενάντια στο Ισλάμ». Στο κήρυγμά του μετά τη Θεία Λειτουργία στον πανηγυρίζοντα Ι. Ναό Αγίων Αποστόλων Φερίκιοϊ, ο Οικουμενικός Πατριάρχης ανέφερε χαρακτηριστικά:
«Ο τουρκικός λαός έχει την ευθύνη της ανάδειξης αυτής της οικουμενικότητας του μνημείου. Η Αγία Σοφία ως μουσείο αποτελεί τόπο και σύμβολο συναντήσεως, αλληλεγγύης και αλληλοκατανοήσεως Χριστιανισμού και Ισλάμ. Μια πιθανή μετατροπή της Αγίας Σοφίας σε τζαμί θα στρέψει εκατομμύρια χριστιανών σε όλο τον κόσμο ενάντια στο Ισλάμ. Το ζητούμενο, όμως, είναι η ενότητα. Έχουμε την προσδοκία ότι στο τέλος θα επικρατήσει η σύνεση και η λογική», τόνισε.